（1）涉及國防利益需要保密的專利申請，由國防知識(shí)產(chǎn)權(quán)局進(jìn)行審查，經(jīng)審查沒有發(fā)現(xiàn)駁回理由的，由專利局根據(jù)國防知識(shí)產(chǎn)權(quán)局的審查意見作出授予國防專利權(quán)的決定，并委托國防知識(shí)產(chǎn)權(quán)局頒發(fā)國防專利證書，同時(shí)在專利公報(bào)上公告國防專利的專利號、申請日和授權(quán)公告日。
國防知識(shí)產(chǎn)權(quán)局專利復(fù)審委員會(huì)作出宣告國防專利權(quán)無效決定的，專利局應(yīng)當(dāng)在專利公報(bào)上公告專利號、授權(quán)公告日、無效宣告決定號和無效宣告決定日。
（2）涉及國防利益以外的國家安全或者重大利益需要保密的發(fā)明或者實(shí)用新型專利申請，由專利局按照以下程序進(jìn)行審查和管理。
審查員應(yīng)當(dāng)對確定需要保密的專利申請案卷作出保密標(biāo)記，在對該專利申請作出解密決定之前，對其進(jìn)行保密管理。保密專利申請的初步審查和實(shí)質(zhì)審查均由專利局指定的審查員進(jìn)行。
對于發(fā)明專利申請，初步審查和實(shí)質(zhì)審查按照與一般發(fā)明專利申請相同的基準(zhǔn)進(jìn)行。初步審查合格的保密專利申請不予公布，實(shí)質(zhì)審查請求符合規(guī)定的，直接進(jìn)入實(shí)質(zhì)審查程序。 經(jīng)實(shí)質(zhì)審查沒有發(fā)現(xiàn)駁回理由的，作出授予保密發(fā)明專利權(quán)的決定，并發(fā)出授予發(fā)明專利權(quán)通知書和辦理登記手續(xù)通知書。

對于實(shí)用新型專利申請，初步審查按照與一般實(shí)用新型專利申請相同的基準(zhǔn)進(jìn)行。經(jīng)初步審查沒有發(fā)現(xiàn)駁回理由的，作出授予保密實(shí)用新型專利權(quán)的決定，并發(fā)出授予實(shí)用新型專利權(quán)通知書和辦理登記手續(xù)通知書。保密專利申請的授權(quán)公告僅公布專利號、申請日和授權(quán)公告日。